Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad17Q6NXW6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad17Q6NXW6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad17Q6NXW6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad17Q6NXW6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad17Q6NXW6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad17Q6NXW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad17Q6NXW6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rad17Q6NXW6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad17Q6NXW6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms