Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Colgalt2Q6NVG7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt2Q6NVG7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms