Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2810408A11RikQ6NSU2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms