Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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