Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt40Q6IFX3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms