Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nop58Q6DFW4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nop58Q6DFW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nop58Q6DFW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms