Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q6DFW0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q6DFW0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q6DFW0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q6DFW0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q6DFW0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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