Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swap70Q6A028 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swap70Q6A028 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Swap70Q6A028 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Swap70Q6A028 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Swap70Q6A028 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Swap70Q6A028 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms