Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Thsd7aQ69ZU6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Thsd7aQ69ZU6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Thsd7aQ69ZU6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thsd7aQ69ZU6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms