Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zcchc2Q69ZB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc2Q69ZB8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc2Q69ZB8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms