Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn4Q69Z26 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cntn4Q69Z26 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntn4Q69Z26 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms