Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sbno1Q689Z5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sbno1Q689Z5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sbno1Q689Z5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sbno1Q689Z5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sbno1Q689Z5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sbno1Q689Z5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sbno1Q689Z5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sbno1Q689Z5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sbno1Q689Z5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sbno1Q689Z5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sbno1Q689Z5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms