Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ino80dQ66JY2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ino80dQ66JY2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ino80dQ66JY2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ino80dQ66JY2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ino80dQ66JY2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ino80dQ66JY2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ino80dQ66JY2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ino80dQ66JY2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ino80dQ66JY2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ino80dQ66JY2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms