Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fgfr1opQ66JX5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fgfr1opQ66JX5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms