Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc8eQ66JT1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc8eQ66JT1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms