Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Top2bQ64511 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Top2bQ64511 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Top2bQ64511 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms