Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms