Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf4Q64287 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf4Q64287 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irf4Q64287 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms