Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc18Q640L5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc18Q640L5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccdc18Q640L5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
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