Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CochQ62507 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CochQ62507 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CochQ62507 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CochQ62507 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CochQ62507 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CochQ62507 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CochQ62507 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CochQ62507 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CochQ62507 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CochQ62507 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CochQ62507 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CochQ62507 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CochQ62507 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CochQ62507 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CochQ62507 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CochQ62507 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CochQ62507 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CochQ62507 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CochQ62507 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CochQ62507 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CochQ62507 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CochQ62507 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CochQ62507 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CochQ62507 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CochQ62507 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CochQ62507 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CochQ62507 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CochQ62507 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CochQ62507 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CochQ62507 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CochQ62507 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CochQ62507 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CochQ62507 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CochQ62507 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CochQ62507 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CochQ62507 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CochQ62507 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CochQ62507 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CochQ62507 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CochQ62507 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CochQ62507 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CochQ62507 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CochQ62507 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CochQ62507 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CochQ62507 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CochQ62507 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CochQ62507 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CochQ62507 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CochQ62507 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CochQ62507 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CochQ62507 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CochQ62507 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CochQ62507 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CochQ62507 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CochQ62507 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CochQ62507 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CochQ62507 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CochQ62507 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CochQ62507 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CochQ62507 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CochQ62507 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CochQ62507 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CochQ62507 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CochQ62507 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CochQ62507 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CochQ62507 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CochQ62507 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CochQ62507 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CochQ62507 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CochQ62507 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CochQ62507 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CochQ62507 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CochQ62507 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CochQ62507 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CochQ62507 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CochQ62507 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CochQ62507 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CochQ62507 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CochQ62507 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms