Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vil1Q62468 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Vil1Q62468 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vil1Q62468 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms