Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vat1Q62465 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vat1Q62465 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms