Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Kdm5dQ62240 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Kdm5dQ62240 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.86
Kdm5dQ62240 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Kdm5dQ62240 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Kdm5dQ62240 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms