Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema5aQ62217 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema5aQ62217 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema5aQ62217 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms