Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn9aQ62205 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn9aQ62205 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn9aQ62205 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms