Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim21Q62191 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms