Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpaQ62189 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpaQ62189 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpaQ62189 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms