Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf1Q62187 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttf1Q62187 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttf1Q62187 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms