Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh1a2Q62148 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms