Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sin3bQ62141 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms