Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf1Q61999 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms