Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prg2Q61878 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prg2Q61878 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms