Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacsin1Q61644 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacsin1Q61644 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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