Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne1Q61457 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccne1Q61457 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne1Q61457 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms