Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift88Q61371 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift88Q61371 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift88Q61371 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms