Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna2Q61301 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna2Q61301 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna2Q61301 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms