Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TmpoQ61033 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TmpoQ61033 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms