Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JrkQ60976 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JrkQ60976 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
JrkQ60976 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JrkQ60976 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
JrkQ60976 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
JrkQ60976 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms