Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep250Q60952 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep250Q60952 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep250Q60952 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep250Q60952 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep250Q60952 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep250Q60952 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms