Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf8Q60846 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms