Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn11Q60771 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn11Q60771 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn11Q60771 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms