Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561Q60720 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561Q60720 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cyb561Q60720 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms