Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nr2f1Q60632 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nr2f1Q60632 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr2f1Q60632 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms