Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CttnQ60598 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CttnQ60598 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CttnQ60598 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms