Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema5bQ60519 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms