Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q5XFZ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5XFZ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5XFZ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms