Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Uimc1Q5U5Q9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Uimc1Q5U5Q9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Uimc1Q5U5Q9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uimc1Q5U5Q9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uimc1Q5U5Q9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Uimc1Q5U5Q9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Uimc1Q5U5Q9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Uimc1Q5U5Q9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Uimc1Q5U5Q9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Uimc1Q5U5Q9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Uimc1Q5U5Q9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uimc1Q5U5Q9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uimc1Q5U5Q9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uimc1Q5U5Q9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms