Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabl6Q5U3K5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rabl6Q5U3K5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms