Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Specc1Q5SXY1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1Q5SXY1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms