Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brip1Q5SXJ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brip1Q5SXJ3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms