Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ankrd40Q5SUE8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms